عنوان المقالة:كشف أوجه التشابه في شفرة الحياة: استكشاف مفصل لخوارزمية مطابقة تسلسل الحمض النووي. Unveiling Similarities in the Code of Life: A Detailed Exploration of DNA Sequence Matching Algorithm.
Shams, M. Y., Farag, R. M., Aldawody, D. A., Khalid, H. E., Essa, A. K., El-Bakry, H. M. ., & Salama, A. A.
الملخص العربي
إن تحديد تسلسلات الحمض النووي المتشابهة أمر بالغ الأهمية في مختلف المساعي البحثية البيولوجية. تتعمق هذه الورقة في العمل المعقد لخوارزمية محددة مصممة لهذا الغرض. نقدم شرحًا منهجيًا، ونستكشف كيف تتعامل الخوارزمية مع مدخلات المستخدم، وتقرأ تسلسلات الحمض النووي المخزنة، وتستخدم نموذج Word2Vec لتمثيل المتجهات، وتحسب تشابه التسلسل باستخدام مقاييس متنوعة مثل تشابه جيب التمام والمسافة النيتروسوفيكية. بالإضافة إلى ذلك، تستكشف الورقة دمج القيم النيتروسوفيكية لمراعاة عدم اليقين في المقارنات. أخيرًا، نناقش استخراج النتائج، بما في ذلك التسلسلات المتطابقة، ودرجات التشابه، ومقاييس الدقة. يوفر هذا الاستكشاف المتعمق فهمًا واضحًا لقدرات الخوارزمية ويعزز تطبيقها الفعال في تحليل تسلسل الحمض النووي.
الملخص الانجليزي
Identifying similar DNA sequences is crucial in various biological research endeavors. This paper delves into the intricate workings of a specific algorithm designed for this purpose. We provide a systematic explanation, exploring how the algorithm handles user input, reads stored DNA sequences, utilizes the Word2Vec model for vector representation, and calculates sequence similarity using diverse metrics like Cosine Similarity and Neutrosophic Distance. Additionally, the paper explores the incorporation of neutrosophic values to account for uncertainty in the comparisons. Finally, we discuss the extraction of results, including matched sequences, similarity scores, and accuracy measures. This in-depth exploration provides a clear understanding of the algorithm's capabilities and fosters its effective application in DNA sequence analysis.
أ.د. أحمد سلامة | Prof. Dr. Ahmed Salama | 10224